離子色譜儀與液相色譜儀一樣，一般也是先做成一個個單元組件，然后根據分析需要將各個單元組件組合起來。zui基本的單元組件是流動相容器、高壓輸液泵、進樣器、色譜柱、檢測器和數據處理系統，也可根據需要配置流動相在線脫氣裝置、梯度洗脫裝置、流動相抑制系統、柱后反應系統和全自動控制系統等。

　　首先、流動相容器：

　　流動相容器通常由一個或多個聚乙稀或硬質玻璃瓶組成。

　　應經常清洗流動相容器和過濾頭，經常更換流動相。

　　二、高壓輸液泵：

　　高壓輸液泵的作用是將流動相以穩定的流速或壓力輸送至色譜分離系統。高壓輸液泵的穩定性直接關系到分析結果的重現性和準確性，是離子色譜儀的關鍵部件之一。高壓輸液泵有恒壓泵和恒流泵，常用的有氣動放大泵、單柱塞往復泵、雙柱塞往復泵和往復式隔膜泵等。

　　三、進樣器：

　　進樣裝置有手動進樣器和自動進樣器。

　　四、色譜柱：

　　色譜柱是實現分離的核心部件，要求柱效高、柱容量大和性能穩定。

　　標準柱內徑為4mm，小內徑柱內徑為2mm。柱長通常在50～100mm，比液相色譜柱短。柱內填充粒徑5～10μm的球形顆粒填料。

　　在微量離子色譜中也用到內徑為數十納米的毛細管柱（包括填充型和內壁修飾型）。

　　色譜柱是有方向的，安裝和更換時一定要注意。

　　離子色譜儀需用保護柱和恒溫裝置。

　　五、檢測器：

　　離子色譜中應用zui多的檢測器是電導檢測器，其次是紫外可見光吸收檢測器、衍生化光度檢測器、安培檢測器、熒光檢測器和在液相色譜中幾乎不被重視的原子發射檢測器。